La educación y la I+D+i constituyen áreas prioritarias en las que la cooperación estratégica con Israel presenta un mayor valor añadido. La excelencia de las Universidades y centros tecnológicos israelíes es mundialmente conocida y la considerable inversión en políticas de innovación han convertido al país en una de las economías más innovadoras del mundo.

Como país asociado, Israel participa además en programas educativos y de movilidad europeos como ERASMUS-MUNDUS y TEMPUS, además de optar como país asociado a los fondos del Séptimo Programa Marco y del Consejo Europeo de Investigación.

Casa Sefarad-Israel desarrolla un creciente programa de actividades dirigidas a promover el conocimiento mutuo y la integración de las comunidades académicas y educativas de ambos países en los siguientes ámbitos:

1. Educación Secundaria: Organización de viajes de estudios, encuentros de estudiantes israelíes y españoles y formación del profesorado.
   
2. Educación Superior: Promoción de convenios de colaboración entre universidades españolas e israelíes. Organización de cursos, seminarios, conferencias, etc, que respondan a los objetivos generales de CSI.
   
3. Investigación e innovación: Organización de encuentros entre responsables de centros tecnológicos y de investigación israelíes y españoles. Difusión de las oportunidades de cooperación en el ámbito del desarrollo tecnológico e investigación científica.
   
4. Becas: Desarrollo de un programa de becas específico de CSI con entidades educativas y financieras españolas para fomentar la internacionalización de la universidad española, la cooperación en proyectos universitarios relacionados con la innovación, la transferencia de tecnología y el fomento de la cultura emprendedora.